Sus coordenadas geográficas con respecto al Meridiano de Greenwinch son:

Latitud Sur: 10º20'02''

Longitud Oeste: 76º10'50''

Comprende el 1.20% de porcentaje territorial de la región Huánuco.

El suelo es muy accidentando, solo una parte de la superficie territorial, es aprovechado como tierra de cultivo y los demás son tierra erial cubierta de pastos naturales. 

El distrito de San Rafael limita:

Por el Norte, con el distrito de Ambo. 

Por el Sur, con los distritos de Pallanchacra y Huariaca (Provincia de Pasco).

Por el Este, con el distrito de Panao (Provincia de Pachitea).

Por el Oeste, con los distritos de Huácar y San Francisco.

 

Panorama del Distrito de San Rafael

Su relieve por ser accidentado presenta numerosas estribaciones como de la Cordillera Negra, Charca y Paglajanca; extensas mesetas, muros escarpados, cumbres afiladas, lomas, colinas, cimeras, desfiladeros y cañadas; también valles estrechos, profundos e interandinos; los contrafuertes: Juschijanca, Blanca, León Huanush, Colqui y Pucamachay.

5 FLORA Y FAUNA

FAUNA: Es el recurso natural de mayor importancia. Entre los animales silvestres tenemos:

- Mamíferos: Zorro, puma, venado, zorrillo, vizcacha, cuy de campo, gato silvestre, muca, ratón y murciélago. 

- Peces: Trucha, challwa y cachpa.

- Aves: Perdiz, zorzal, pito, picaflor, gorrión, gavilán, dominico, ayagchiuchu, cernícalo, cóndor y búho (tucú).

- Reptiles: Lagartijas y culebra.

- Insectos: Mariposa, mosca, grillo, abeja, saltamontes, avispa, libélula, alacrán, ciempiés, cochinilla, araña,

- Batracios: Sapo y ranas. 

FLORA: Es otro recurso natural de importancia económica, tenemos:

- Maderables: Eucalipto, sauce, ciprés, pino y árbol morado.

- Arbolillos: Aliso, cereza, molle, tara, huarango y casuarina, etc.

- Arbustos: Chamana, zarza, arrayán, chilca, rosa y muña.

- Mata: Retama, marco y otras.

- Herbáceas: Ichu, laya, mala hierba, etc.

- Carnosas: Tuna, barbasco, sábila, gigantón y huallanca.

- Estípites: Cabuya azul y verde.

- Rastreros: Grama, verdolaga y fresal.

- Trepadores: Zarcillo, vid, calabaza, zapallo, huano, caihua.

- Legumbres: Frijoles, habas, lentejas, tarwi (chocho), etc.

- Rizomas: Carrizo, lirio y lenguaycerva.

- Plantas curativas: Huamanripa, escorzonera, ortiga, cola de caballo, huira huira, paico, janca amapola, ogsha turpo, tapo, blanca guasha, guaman shanca, puma shanca, etc. 

- Plantas criptogámicas: Mugo, alga, hongo y helecho.

- Flores: Dalia, clavel, rosa, azucena, violeta, retama, geranio, achira, san josé, lirio, cartucho, etc.

Típica flora del pueblo de San Rafael

6. CLIMA

En su parte baja, es de bosque pluvial Pre Montano Tropical y la parte alta tiene el bosque muy Húmedo – Montano Tropical; por lo que su zona de vida presenta un clima templado seco en su valle y frío en las alturas; con una temperatura que varia entre los 7° y 23° C.; y una humedad atmosférica de 56%. Las precipitaciones fluviales varían en intensidad, según las épocas del año. Las fuertes lluvias se presentan en los meses de invierno, entre noviembre y marzo, que causan los desastrosos huaycos en especial en la zona de Uchuc Huariaca. Las heladas en verano se producen entre mayo y agosto, siendo las regiones puna, suni y janca las que sufren con más intensidad de estos fenómenos y con menor intensidad la región quechua.

El clima de San Rafael es templado seco en su valle

* Recursos Potamológicos.- El distrito cuenta varios ríos destacando los siguientes:

- Río Huariaca.- Nace de los deshielos de la Cordillera de Pucayacu, en las inmediaciones de la localidad de Cerro de Pasco y corre de sur a norte, donde afluyen todos ríos en mención al distrito, de ahí se unirá con el río Huertas en Ambo para formar y dar nombre al río Huallaga.

- Río Blanco.- Nace en la laguna de Huascacocha, en las alturas de la Comunidad de San Joaquín. La subcuenca secundaria del río Blanco, tiene una extensión de 257.8 km² tiene una longitud de cauce de 36.5 km, con una pendiente media de 5.3 % que baja de los 4,400 a los 2,450 m.s.n.m. La línea de cumbres va de los 4,800 a los 3,600 m.s.n.m.

- Río Carmen.- Nace en la laguna de Shinimachay, en las alturas de Chacos.

Otros: Independencia, Rumichaca, Batán, Wengomayu, Pomabamba, Tarumayo, Sexura y Zangote.

Río Blanco fluyendo en el Huariaca

Avance del río Huariaca y sus ramales Batán y Pomabamba

<sup>Laguna de Tingococha


Laguna de Lajas</sup>

8. DEMOGRAFÍA

Según los datos estadísticos del Censo Nacional 2007: XI de Población y VI de Vivienda, el distrito de San Rafael cuenta con 11,604 habitantes, con una con una densidad de 26.16 Hab/Km²

Señoras de la localidad de Pillao

9. CENTROS POBLADOS